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Sequenzierung von Metagenom und Metatranskriptom in Extrakten aus Sedimentproben und Mikrokosmos-Studien

Bundesanstalt für Gewässerkunde

Angebotsfrist: 12 Oktober 2023.

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Beträge und Kennzahlen

1
Lose

Beschreibung

Gegenstand der Ausschreibung ist die Durchführung von Metagenom- sowie Metatranskriptomsequenzierungen zur taxonomischen wie funktionellen Charakterisierung prokaryotischer Lebensgemeinschaften aus Umwelt- und Mikrokosmosprobe. Die Analysen müssen zur Erreichung der notwendigen Sequenziertiefe mittels Hochdurchsatzsequenzierung unter Verwendung der Illumina Sequenziertechnologie erfolgen. Die Leistung ist dabei in folgende zwei Arbeitspakete unterteilt: Arbeitspaket 1 - Metagenomsequenzierung von total DNA aus Umwelt- und Mikrokosmosproben - Qualitätskontrolle der durch den Auftraggeber (AG) gelieferten DNA-Proben - DNA Fragmentierung der durch den AG gelieferten DNA-Extrakte (total DNA) von insgesamt maximal 160 Proben - Erstellung der Whole-Genome-Sequencing Library aus den Proben - Aufreinigung, Normalisierung und QC der WGS-Library - Anwendung der Methode des bidirektionalen „paired-end sequencing“ (PE) mit 2 x 150 bp und >=50 Mio Reads pro Sample - Bei den gelieferten Daten müssen mindestens 75% der Basen die Qualität Q30 oder besser besitzen. - Die Sequenzrohdaten müssen vom AN in einem vom AG weiterbearbeitbaren Format (FASTQ-Format) geliefert werden und gemäß ihrer Probenzu…

Teilnahmebedingungen

  • Erklärung über das Nichtvorliegen von Ausschlussgründen gemäß §§ 123, 124 GWB - Erklärung, dass eine Berufshaftpflichtversicherung / eine…

Änderungen

  • Das Vergabeverfahren wurde eingestellt

Amtliche Veröffentlichungen

MediumReferenzDatum
OEV 2d349966-6654-4fba-8a28-33830813f99e-2 20 November 2023

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Häufig gestellte Fragen

Bis wann kann ein Angebot für diese Ausschreibung eingereicht werden?
Die Angebotsfrist endet am 12 Oktober 2023, 10:00. Prüfen Sie die offizielle Quelle, da Termine geändert werden können.
Wer ist der Auftraggeber dieser Ausschreibung?
Die Vergabestelle ist Bundesanstalt für Gewässerkunde (Deutschland).
Wie kann ich mich an öffentlichen Ausschreibungen in Deutschland beteiligen?
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