Sequenzierung von Metagenom und Metatranskriptom in Extrakten aus Sedimentproben und Mikrokosmos-Studien
Auftraggeber: Bundesanstalt für Gewässerkunde
- Veröffentlicht
- 20 November 2023
- Angebotsfrist
- 12 Oktober 2023, 10:00
- Verfahren
- Offenes Verfahren
- Lose
- 1
- Unterlagen
- 1
- Bekanntmachungsnummer
- 2d349966-6654-4fba-8a28-33830813f99e-2
- Referenz
- 26d858ca-5c6b-4151-b1f5-851d42c3a2ef
- Offizielle Quelle
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CPV-Codes
- 73111000Servicios de laboratorio de investigación
Beschreibung
Gegenstand der Ausschreibung ist die Durchführung von Metagenom- sowie Metatranskriptomsequenzierungen zur taxonomischen wie funktionellen Charakterisierung prokaryotischer Lebensgemeinschaften aus Umwelt- und Mikrokosmosprobe. Die Analysen müssen zur Erreichung der notwendigen Sequenziertiefe mittels Hochdurchsatzsequenzierung unter Verwendung der Illumina Sequenziertechnologie erfolgen. Die Leistung ist dabei in folgende zwei Arbeitspakete unterteilt: Arbeitspaket 1 - Metagenomsequenzierung von total DNA aus Umwelt- und Mikrokosmosproben - Qualitätskontrolle der durch den Auftraggeber (AG) gelieferten DNA-Proben - DNA Fragmentierung der durch den AG gelieferten DNA-Extrakte (total DNA) von insgesamt maximal 160 Proben - Erstellung der Whole-Genome-Sequencing Library aus den Proben - Aufreinigung, Normalisierung und QC der WGS-Library - Anwendung der Methode des bidirektionalen „paired-end sequencing“ (PE) mit 2 x 150 bp und >=50 Mio Reads pro Sample - Bei den gelieferten Daten müssen mindestens 75% der Basen die Qualität Q30 oder besser besitzen. - Die Sequenzrohdaten müssen vom AN in einem vom AG weiterbearbeitbaren Format (FASTQ-Format) geliefert werden und gemäß ihrer Probenzu…
Amtliche Veröffentlichungen
- OEV · 2d349966-6654-4fba-8a28-33830813f99e-2 · 20 November 2023
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Häufig gestellte Fragen
- Bis wann kann ein Angebot für diese Ausschreibung eingereicht werden?
- Die Angebotsfrist endet am 12 Oktober 2023, 10:00. Prüfen Sie die offizielle Quelle, da Termine geändert werden können.
- Wer ist der Auftraggeber dieser Ausschreibung?
- Die Vergabestelle ist Bundesanstalt für Gewässerkunde (Deutschland).
- Wie kann ich mich an öffentlichen Ausschreibungen in Deutschland beteiligen?
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