Sequenzierung von Metagenom und Metatranskriptom in Extrakten aus Sedimentproben und Mikrokosmos-Studien

Veröffentlicht

15 März 2024

Angebotsfrist

9 April 2024, 10:00

Verfahren

Offenes Verfahren

Lose

1

Unterlagen

1

Bekanntmachungsnummer

1ad58024-ac32-41c0-b072-8bb51ae91531-1

Referenz

84b21442-2f9c-4692-8c40-c2141f538681

Offizielle Quelle

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CPV-Codes

• 73111000Servicios de laboratorio de investigación

Beschreibung

Gegenstand der Ausschreibung ist die Durchführung von Metagenom- sowie Metatranskriptomsequenzierungen zur taxonomischen wie funktionellen Charakterisierung prokaryotischer Lebensgemeinschaften aus Umwelt- und Mikrokosmosproben durch den Auftragnehmer (AN). Die Analysen müssen zur Erreichung der notwendigen Sequenziertiefe mittels Hochdurchsatzsequenzierung unter Verwendung der Illumina Sequenziertechnologie erfolgen. Die Leistung ist dabei in folgende zwei Arbeitspakete unterteilt: Arbeitspaket 1: Metagenomsequenzierung von total DNA aus Umwelt- und Mikrokosmosproben Arbeitspaket 2: Metatranskriptomsequenzierung von total RNA aus Umwelt- und Mikrokosmosproben zu Arbeitspaket 1: - Qualitätskontrolle der durch den Auftraggeber (AG) gelieferten DNA-Proben - DNA Fragmentierung der durch den AG gelieferten DNA-Extrakte (total DNA) von ins-gesamt maximal 160 Proben - Erstellung der Whole-Genome-Sequencing Library aus den Proben - Aufreinigung, Normalisierung und QC der WGS-Library - Anwendung der Methode des bidirektionalen „paired-end sequencing“ (PE) mit 2 x 150 bp und >=50 Mio Reads pro Sample (gewünscht sind 50M reads und damit 25M read pairs) - Bei den gelieferten Daten müssen mind…

Amtliche Veröffentlichungen

• OEV · 1ad58024-ac32-41c0-b072-8bb51ae91531-1 · 15 März 2024

Häufig gestellte Fragen

Bis wann kann ein Angebot für diese Ausschreibung eingereicht werden?

Die Angebotsfrist endet am 9 April 2024, 10:00. Prüfen Sie die offizielle Quelle, da Termine geändert werden können.

Wer ist der Auftraggeber dieser Ausschreibung?

Die Vergabestelle ist Bundesansalt für Gewässerkunde (Deutschland).

Wie kann ich mich an öffentlichen Ausschreibungen in Deutschland beteiligen?

Angebote werden über das offizielle Vergabeportal von Deutschland eingereicht. El Vínculo hilft Ihnen, Ausschreibungen zu finden und ihre Unterlagen zu analysieren; die Angebotsabgabe erfolgt immer bei der offiziellen Quelle.